Proyecto Hombre cuenta con programas de prevención universal que son aplicados en los ámbitos escolar y familiar y programas de prevención selectiva en las aulas.

Algunos ejemplos de prevención universal para Primaria son el programa “Entre Todos” o el que se aplica a los últimos cursos de Primaria y en todo el ciclo de Secundaria «Juego de Llaves». Estos programas pretenden mejorar la competencia personal y los recursos del alumnado, para evitar posibles consumos de drogas o retrasar la edad de inicio en la experimentación de las mismas, a través del aprendizaje de ciertas habilidades, implicando a toda la comunidad educativa (alumnado, profesorado y familias).

En prevención selectiva, programas como «Rompecabezas» en las aulas o » A tiempo» para familias se trabajan también en el ámbito escolar.

Desde 2001 Proyecto Hombre trabaja la prevención escolar